南麂列島地處臺(tái)灣暖流與江浙沿岸流交匯和交替消漲的海區(qū)，屬亞熱帶海洋季風(fēng)氣候。區(qū)內(nèi)海洋生物物種繁多，區(qū)系成分復(fù)雜，自然生態(tài)系統(tǒng)保存良好，生物種類(lèi)有很多：魚(yú)類(lèi)397種、蝦類(lèi)79種、蟹類(lèi)128種，而貝藻品種之齊全居各海域之冠。本區(qū)已鑒定的海洋貝類(lèi)有403種，其中19種為國(guó)內(nèi)首次記錄，海洋底棲藻類(lèi)有174種，其中黑葉馬尾藻為世界海洋藻類(lèi)的新種，貝藻類(lèi)種數(shù)約占全國(guó)的29% 以上。本區(qū)的貝藻類(lèi)不僅種類(lèi)豐富，而且還具有溫、熱帶兩種區(qū)系特征和地域上的斷裂分布現(xiàn)象，堪稱(chēng)我國(guó)近海貝藻類(lèi)的一個(gè)重要基因庫(kù)。